Ekosistemų modeliavimas padeda mokiniams suprasti, kaip skirtingos ekosistemos dalys yra tarpusavyje susijusios ir kaip pokyčiai vienoje srityje gali paveikti visą sistemą. Modeliuodami mokiniai ugdo kritinio mąstymo įgūdžius, tikrindami idėjas, analizuodami rezultatus ir tyrinėdami priežasties ir pasekmės ryšius. Ekosistemų modeliavimo mokymas taip pat susieja mokymąsi su realaus pasaulio problemomis, tokiomis kaip klimato kaita, biologinės įvairovės nykimas ir tarša. Mokiniai įgyja vertingos patirties dirbdami su duomenimis, technologijomis ir kompiuteriniu mąstymu, paruošdami juos ateities moksliniams ir skaitmeniniams iššūkiams. Interaktyvūs modeliavimai padaro matomus sudėtingus ekologinius procesus ir leidžia studentams tyrinėti scenarijus, kurių nebūtų įmanoma išbandyti realiame gyvenime, todėl mokslas tampa patrauklus ir prasmingas.